Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD44P16070 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD44P16070 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD44P16070 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD44P16070 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD44P16070 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD44P16070 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD44P16070 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD44P16070 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD44P16070 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD44P16070 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD44P16070 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD44P16070 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD44P16070 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD44P16070 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD44P16070 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD44P16070 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD44P16070 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD44P16070 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD44P16070 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD44P16070 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD44P16070 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD44P16070 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CD44P16070 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD44P16070 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD44P16070 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD44P16070 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CD44P16070 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD44P16070 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD44P16070 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD44P16070 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD44P16070 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD44P16070 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD44P16070 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD44P16070 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD44P16070 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD44P16070 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD44P16070 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD44P16070 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD44P16070 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD44P16070 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD44P16070 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD44P16070 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD44P16070 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD44P16070 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD44P16070 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD44P16070 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD44P16070 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD44P16070 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD44P16070 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD44P16070 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD44P16070 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD44P16070 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD44P16070 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD44P16070 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD44P16070 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD44P16070 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD44P16070 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD44P16070 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD44P16070 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD44P16070 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms