Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA3P15088 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA3P15088 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA3P15088 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA3P15088 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA3P15088 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA3P15088 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA3P15088 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA3P15088 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA3P15088 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA3P15088 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA3P15088 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA3P15088 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA3P15088 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA3P15088 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA3P15088 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA3P15088 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA3P15088 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA3P15088 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA3P15088 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA3P15088 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA3P15088 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA3P15088 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms