Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CFTRP13569 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CFTRP13569 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CFTRP13569 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CFTRP13569 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CFTRP13569 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CFTRP13569 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CFTRP13569 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CFTRP13569 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CFTRP13569 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CFTRP13569 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CFTRP13569 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CFTRP13569 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
CFTRP13569 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CFTRP13569 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CFTRP13569 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CFTRP13569 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CFTRP13569 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CFTRP13569 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CFTRP13569 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CFTRP13569 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
CFTRP13569 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CFTRP13569 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CFTRP13569 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CFTRP13569 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CFTRP13569 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CFTRP13569 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CFTRP13569 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CFTRP13569 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CFTRP13569 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CFTRP13569 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CFTRP13569 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CFTRP13569 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
CFTRP13569 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CFTRP13569 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CFTRP13569 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CFTRP13569 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CFTRP13569 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CFTRP13569 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CFTRP13569 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CFTRP13569 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFTRP13569 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFTRP13569 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CFTRP13569 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CFTRP13569 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CFTRP13569 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CFTRP13569 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CFTRP13569 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CFTRP13569 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CFTRP13569 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CFTRP13569 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CFTRP13569 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CFTRP13569 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFTRP13569 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFTRP13569 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFTRP13569 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CFTRP13569 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CFTRP13569 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CFTRP13569 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
CFTRP13569 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CFTRP13569 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CFTRP13569 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CFTRP13569 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
CFTRP13569 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CFTRP13569 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CFTRP13569 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CFTRP13569 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CFTRP13569 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CFTRP13569 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CFTRP13569 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CFTRP13569 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CFTRP13569 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CFTRP13569 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CFTRP13569 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC41.19■■■■■ 4.19
CFTRP13569 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CFTRP13569 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CFTRP13569 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CFTRP13569 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CFTRP13569 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CFTRP13569 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CFTRP13569 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CFTRP13569 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CFTRP13569 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CFTRP13569 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CFTRP13569 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CFTRP13569 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CFTRP13569 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CFTRP13569 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CFTRP13569 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
CFTRP13569 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CFTRP13569 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CFTRP13569 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CFTRP13569 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CFTRP13569 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFTRP13569 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CFTRP13569 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CFTRP13569 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CFTRP13569 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CFTRP13569 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CFTRP13569 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms