Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COX4I1P13073 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms