Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFTPCP11686 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPCP11686 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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