Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1P11387 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1P11387 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1P11387 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1P11387 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1P11387 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP1P11387 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP1P11387 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP1P11387 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP1P11387 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1P11387 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1P11387 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1P11387 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1P11387 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1P11387 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1P11387 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1P11387 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1P11387 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP1P11387 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP1P11387 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP1P11387 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP1P11387 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP1P11387 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP1P11387 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP1P11387 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1P11387 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1P11387 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1P11387 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1P11387 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1P11387 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1P11387 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1P11387 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1P11387 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1P11387 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1P11387 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1P11387 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1P11387 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1P11387 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1P11387 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1P11387 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1P11387 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1P11387 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1P11387 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1P11387 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1P11387 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1P11387 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1P11387 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1P11387 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1P11387 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1P11387 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP1P11387 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP1P11387 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOP1P11387 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1P11387 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1P11387 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1P11387 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1P11387 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1P11387 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1P11387 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1P11387 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1P11387 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP1P11387 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP1P11387 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP1P11387 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP1P11387 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP1P11387 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP1P11387 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP1P11387 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP1P11387 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1P11387 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1P11387 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1P11387 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1P11387 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms