Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBP11277 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBP11277 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBP11277 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBP11277 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBP11277 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBP11277 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBP11277 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBP11277 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBP11277 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBP11277 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBP11277 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBP11277 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBP11277 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBP11277 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTBP11277 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBP11277 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBP11277 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBP11277 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBP11277 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBP11277 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBP11277 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBP11277 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBP11277 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBP11277 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBP11277 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBP11277 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBP11277 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBP11277 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBP11277 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBP11277 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBP11277 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBP11277 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBP11277 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBP11277 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBP11277 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBP11277 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBP11277 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBP11277 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBP11277 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBP11277 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBP11277 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBP11277 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBP11277 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBP11277 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBP11277 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBP11277 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBP11277 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBP11277 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBP11277 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBP11277 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBP11277 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBP11277 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBP11277 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBP11277 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBP11277 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms