Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMC1P11047 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LAMC1P11047 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC1P11047 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC1P11047 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC1P11047 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC1P11047 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC1P11047 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC1P11047 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC1P11047 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC1P11047 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.79■■■■□ 3
LAMC1P11047 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC1P11047 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC1P11047 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC1P11047 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC1P11047 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LAMC1P11047 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC1P11047 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC1P11047 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC1P11047 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC1P11047 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
LAMC1P11047 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms