Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2P10911 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2P10911 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2P10911 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2P10911 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2P10911 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2P10911 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCF2P10911 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCF2P10911 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCF2P10911 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCF2P10911 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCF2P10911 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2P10911 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2P10911 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2P10911 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2P10911 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2P10911 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2P10911 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2P10911 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2P10911 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2P10911 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2P10911 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2P10911 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCF2P10911 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCF2P10911 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCF2P10911 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCF2P10911 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2P10911 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2P10911 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2P10911 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2P10911 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2P10911 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2P10911 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2P10911 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2P10911 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2P10911 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCF2P10911 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCF2P10911 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCF2P10911 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCF2P10911 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCF2P10911 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCF2P10911 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2P10911 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2P10911 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2P10911 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2P10911 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2P10911 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2P10911 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2P10911 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCF2P10911 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCF2P10911 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCF2P10911 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCF2P10911 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCF2P10911 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2P10911 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2P10911 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2P10911 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2P10911 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2P10911 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2P10911 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2P10911 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2P10911 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2P10911 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2P10911 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2P10911 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2P10911 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2P10911 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2P10911 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms