Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD28P10747 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD28P10747 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD28P10747 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD28P10747 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD28P10747 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD28P10747 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD28P10747 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD28P10747 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD28P10747 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD28P10747 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD28P10747 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD28P10747 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD28P10747 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD28P10747 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD28P10747 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD28P10747 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD28P10747 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD28P10747 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD28P10747 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD28P10747 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD28P10747 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD28P10747 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD28P10747 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD28P10747 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD28P10747 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD28P10747 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD28P10747 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD28P10747 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD28P10747 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CD28P10747 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD28P10747 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD28P10747 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD28P10747 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD28P10747 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD28P10747 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms