Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIMD1P0DJR0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIMD1P0DJR0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms