Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBBP0CG47 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms