Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM58BPP0C7Q3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM58BPP0C7Q3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM58BPP0C7Q3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms