Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP3A4P08684 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP3A4P08684 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP3A4P08684 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP3A4P08684 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms