Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BAP07359 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BAP07359 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP1BAP07359 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms