Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPBP07199 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPBP07199 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPBP07199 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPBP07199 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPBP07199 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPBP07199 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPBP07199 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPBP07199 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPBP07199 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPBP07199 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPBP07199 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPBP07199 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPBP07199 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPBP07199 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPBP07199 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPBP07199 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPBP07199 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPBP07199 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPBP07199 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPBP07199 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPBP07199 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPBP07199 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPBP07199 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPBP07199 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPBP07199 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPBP07199 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPBP07199 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPBP07199 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPBP07199 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPBP07199 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPBP07199 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPBP07199 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPBP07199 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPBP07199 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPBP07199 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPBP07199 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPBP07199 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPBP07199 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPBP07199 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPBP07199 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPBP07199 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPBP07199 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPBP07199 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPBP07199 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPBP07199 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPBP07199 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPBP07199 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPBP07199 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPBP07199 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPBP07199 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPBP07199 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPBP07199 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPBP07199 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPBP07199 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPBP07199 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPBP07199 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPBP07199 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPBP07199 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPBP07199 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPBP07199 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPBP07199 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPBP07199 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPBP07199 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPBP07199 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPBP07199 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPBP07199 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPBP07199 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPBP07199 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPBP07199 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPBP07199 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPBP07199 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPBP07199 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPBP07199 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPBP07199 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPBP07199 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPBP07199 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms