Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLBP06746 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLBP06746 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLBP06746 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLBP06746 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLBP06746 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLBP06746 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLBP06746 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLBP06746 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLBP06746 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLBP06746 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
POLBP06746 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLBP06746 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLBP06746 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLBP06746 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLBP06746 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLBP06746 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLBP06746 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLBP06746 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLBP06746 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLBP06746 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLBP06746 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLBP06746 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLBP06746 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLBP06746 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLBP06746 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLBP06746 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLBP06746 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLBP06746 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLBP06746 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLBP06746 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLBP06746 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLBP06746 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLBP06746 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLBP06746 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLBP06746 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLBP06746 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLBP06746 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLBP06746 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLBP06746 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLBP06746 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLBP06746 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLBP06746 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLBP06746 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLBP06746 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLBP06746 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLBP06746 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLBP06746 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms