Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCG5P05408 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG5P05408 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG5P05408 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCG5P05408 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG5P05408 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG5P05408 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG5P05408 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCG5P05408 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCG5P05408 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCG5P05408 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCG5P05408 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCG5P05408 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG5P05408 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG5P05408 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG5P05408 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG5P05408 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG5P05408 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG5P05408 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG5P05408 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG5P05408 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG5P05408 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG5P05408 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCG5P05408 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG5P05408 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG5P05408 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG5P05408 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG5P05408 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG5P05408 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG5P05408 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG5P05408 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG5P05408 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms