Protein–RNA interactions for Protein: P04150

NR3C1, Glucocorticoid receptor, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1P04150 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR3C1P04150 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NR3C1P04150 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms