Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL10P02778 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL10P02778 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL10P02778 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CXCL10P02778 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL10P02778 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL10P02778 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms