Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms