Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNB1P01574 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms