Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TIMP1P01033 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMP1P01033 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms