Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTL6AO96019 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6AO96019 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6AO96019 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6AO96019 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6AO96019 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6AO96019 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6AO96019 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6AO96019 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6AO96019 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6AO96019 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6AO96019 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6AO96019 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6AO96019 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6AO96019 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6AO96019 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6AO96019 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6AO96019 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6AO96019 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6AO96019 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6AO96019 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6AO96019 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6AO96019 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6AO96019 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6AO96019 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6AO96019 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms