Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYF2O95926 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYF2O95926 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYF2O95926 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYF2O95926 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYF2O95926 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYF2O95926 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYF2O95926 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYF2O95926 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYF2O95926 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYF2O95926 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYF2O95926 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYF2O95926 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYF2O95926 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYF2O95926 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYF2O95926 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYF2O95926 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYF2O95926 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYF2O95926 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYF2O95926 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYF2O95926 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYF2O95926 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYF2O95926 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYF2O95926 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYF2O95926 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYF2O95926 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYF2O95926 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYF2O95926 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYF2O95926 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYF2O95926 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYF2O95926 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYF2O95926 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYF2O95926 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYF2O95926 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYF2O95926 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYF2O95926 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYF2O95926 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYF2O95926 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYF2O95926 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYF2O95926 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYF2O95926 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYF2O95926 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYF2O95926 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYF2O95926 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYF2O95926 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYF2O95926 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms