Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAMBPO95630 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAMBPO95630 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms