Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLR1AO95602 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
POLR1AO95602 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms