Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGDSO95455 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGDSO95455 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGDSO95455 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGDSO95455 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGDSO95455 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGDSO95455 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGDSO95455 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TGDSO95455 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGDSO95455 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TGDSO95455 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGDSO95455 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGDSO95455 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGDSO95455 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGDSO95455 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TGDSO95455 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGDSO95455 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGDSO95455 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGDSO95455 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGDSO95455 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGDSO95455 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGDSO95455 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGDSO95455 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGDSO95455 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGDSO95455 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGDSO95455 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGDSO95455 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TGDSO95455 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TGDSO95455 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGDSO95455 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGDSO95455 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGDSO95455 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TGDSO95455 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGDSO95455 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGDSO95455 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGDSO95455 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGDSO95455 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGDSO95455 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TGDSO95455 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGDSO95455 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGDSO95455 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGDSO95455 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGDSO95455 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms