Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRATO95237 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRATO95237 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRATO95237 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRATO95237 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRATO95237 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRATO95237 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRATO95237 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRATO95237 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRATO95237 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRATO95237 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRATO95237 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRATO95237 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRATO95237 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRATO95237 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRATO95237 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRATO95237 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRATO95237 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRATO95237 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRATO95237 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRATO95237 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRATO95237 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRATO95237 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRATO95237 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRATO95237 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRATO95237 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRATO95237 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRATO95237 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRATO95237 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRATO95237 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRATO95237 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRATO95237 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms