Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BBOX1O75936 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BBOX1O75936 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BBOX1O75936 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms