Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCATO75600 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCATO75600 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCATO75600 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCATO75600 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCATO75600 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCATO75600 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCATO75600 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCATO75600 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCATO75600 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCATO75600 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCATO75600 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCATO75600 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCATO75600 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCATO75600 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCATO75600 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCATO75600 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCATO75600 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCATO75600 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCATO75600 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCATO75600 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCATO75600 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCATO75600 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCATO75600 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCATO75600 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCATO75600 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCATO75600 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCATO75600 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCATO75600 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCATO75600 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCATO75600 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCATO75600 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCATO75600 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCATO75600 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCATO75600 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCATO75600 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCATO75600 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCATO75600 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCATO75600 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCATO75600 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCATO75600 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCATO75600 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCATO75600 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCATO75600 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCATO75600 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCATO75600 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCATO75600 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCATO75600 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCATO75600 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCATO75600 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCATO75600 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms