Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKAP2O75563 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms