Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC45O75419 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC45O75419 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC45O75419 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC45O75419 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC45O75419 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC45O75419 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC45O75419 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC45O75419 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC45O75419 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC45O75419 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC45O75419 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC45O75419 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC45O75419 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC45O75419 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDC45O75419 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC45O75419 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC45O75419 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC45O75419 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC45O75419 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC45O75419 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC45O75419 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC45O75419 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC45O75419 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC45O75419 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC45O75419 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC45O75419 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDC45O75419 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDC45O75419 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDC45O75419 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC45O75419 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC45O75419 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC45O75419 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC45O75419 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC45O75419 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC45O75419 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC45O75419 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC45O75419 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC45O75419 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC45O75419 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC45O75419 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC45O75419 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC45O75419 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC45O75419 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC45O75419 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC45O75419 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC45O75419 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC45O75419 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC45O75419 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC45O75419 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC45O75419 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC45O75419 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC45O75419 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC45O75419 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC45O75419 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC45O75419 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC45O75419 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC45O75419 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC45O75419 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC45O75419 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC45O75419 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC45O75419 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC45O75419 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC45O75419 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC45O75419 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC45O75419 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC45O75419 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC45O75419 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC45O75419 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC45O75419 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC45O75419 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC45O75419 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC45O75419 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC45O75419 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC45O75419 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC45O75419 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC45O75419 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC45O75419 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC45O75419 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC45O75419 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC45O75419 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC45O75419 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC45O75419 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC45O75419 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC45O75419 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms