Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF9O60383 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF9O60383 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF9O60383 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF9O60383 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF9O60383 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF9O60383 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF9O60383 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF9O60383 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF9O60383 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF9O60383 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF9O60383 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF9O60383 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF9O60383 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF9O60383 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF9O60383 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF9O60383 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF9O60383 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF9O60383 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF9O60383 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF9O60383 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF9O60383 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF9O60383 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF9O60383 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF9O60383 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF9O60383 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF9O60383 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF9O60383 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF9O60383 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GDF9O60383 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF9O60383 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF9O60383 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF9O60383 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF9O60383 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF9O60383 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF9O60383 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF9O60383 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF9O60383 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF9O60383 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF9O60383 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF9O60383 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF9O60383 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF9O60383 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF9O60383 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF9O60383 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF9O60383 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF9O60383 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF9O60383 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF9O60383 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF9O60383 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF9O60383 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF9O60383 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF9O60383 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF9O60383 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 735.9 ms