Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
URB1O60287 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
URB1O60287 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
URB1O60287 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
URB1O60287 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
URB1O60287 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
URB1O60287 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
URB1O60287 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
URB1O60287 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
URB1O60287 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
URB1O60287 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
URB1O60287 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
URB1O60287 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
URB1O60287 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
URB1O60287 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
URB1O60287 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
URB1O60287 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
URB1O60287 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
URB1O60287 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
URB1O60287 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
URB1O60287 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
URB1O60287 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
URB1O60287 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
URB1O60287 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
URB1O60287 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
URB1O60287 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
URB1O60287 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
URB1O60287 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
URB1O60287 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
URB1O60287 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
URB1O60287 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
URB1O60287 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
URB1O60287 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
URB1O60287 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
URB1O60287 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
URB1O60287 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
URB1O60287 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
URB1O60287 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
URB1O60287 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
URB1O60287 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
URB1O60287 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
URB1O60287 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
URB1O60287 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
URB1O60287 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
URB1O60287 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
URB1O60287 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
URB1O60287 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
URB1O60287 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
URB1O60287 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
URB1O60287 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
URB1O60287 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
URB1O60287 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
URB1O60287 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
URB1O60287 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
URB1O60287 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
URB1O60287 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
URB1O60287 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
URB1O60287 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
URB1O60287 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
URB1O60287 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms