Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX1O43933 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX1O43933 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX1O43933 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX1O43933 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX1O43933 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX1O43933 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX1O43933 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX1O43933 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX1O43933 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX1O43933 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX1O43933 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX1O43933 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX1O43933 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX1O43933 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX1O43933 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX1O43933 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX1O43933 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX1O43933 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX1O43933 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX1O43933 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX1O43933 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX1O43933 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX1O43933 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX1O43933 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX1O43933 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX1O43933 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX1O43933 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX1O43933 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX1O43933 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX1O43933 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX1O43933 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX1O43933 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX1O43933 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms