Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM44O43615 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms