Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMTOR5O43504 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMTOR5O43504 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR5O43504 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms