Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA2O43364 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms