Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM2O43147 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms