Protein–RNA interactions for Protein: O15305

PMM2, Phosphomannomutase 2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM2O15305 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMM2O15305 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMM2O15305 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMM2O15305 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMM2O15305 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMM2O15305 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMM2O15305 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMM2O15305 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMM2O15305 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMM2O15305 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMM2O15305 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMM2O15305 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMM2O15305 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMM2O15305 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMM2O15305 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMM2O15305 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMM2O15305 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMM2O15305 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMM2O15305 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMM2O15305 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMM2O15305 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMM2O15305 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMM2O15305 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMM2O15305 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMM2O15305 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMM2O15305 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMM2O15305 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMM2O15305 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMM2O15305 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMM2O15305 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMM2O15305 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMM2O15305 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMM2O15305 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMM2O15305 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMM2O15305 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMM2O15305 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMM2O15305 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMM2O15305 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMM2O15305 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMM2O15305 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PMM2O15305 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMM2O15305 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMM2O15305 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMM2O15305 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PMM2O15305 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PMM2O15305 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PMM2O15305 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMM2O15305 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms