Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD28O15084 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD28O15084 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms