Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2LO15068 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2LO15068 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCF2LO15068 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms