Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA3EO15041 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA3EO15041 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms