Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RIMBP2O15034 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIMBP2O15034 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIMBP2O15034 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIMBP2O15034 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms