Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF646O15015 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF646O15015 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF646O15015 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF646O15015 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms