Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXLO00592 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXLO00592 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXLO00592 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXLO00592 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXLO00592 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXLO00592 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXLO00592 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXLO00592 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXLO00592 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXLO00592 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXLO00592 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXLO00592 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXLO00592 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXLO00592 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXLO00592 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXLO00592 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXLO00592 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXLO00592 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXLO00592 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXLO00592 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXLO00592 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXLO00592 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXLO00592 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXLO00592 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXLO00592 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXLO00592 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXLO00592 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXLO00592 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXLO00592 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PODXLO00592 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PODXLO00592 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PODXLO00592 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PODXLO00592 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PODXLO00592 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PODXLO00592 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PODXLO00592 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PODXLO00592 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PODXLO00592 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PODXLO00592 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PODXLO00592 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PODXLO00592 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PODXLO00592 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PODXLO00592 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PODXLO00592 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PODXLO00592 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PODXLO00592 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PODXLO00592 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PODXLO00592 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PODXLO00592 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PODXLO00592 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PODXLO00592 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PODXLO00592 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PODXLO00592 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PODXLO00592 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms