Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEN1O00255 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEN1O00255 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEN1O00255 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEN1O00255 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEN1O00255 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEN1O00255 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEN1O00255 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEN1O00255 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEN1O00255 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEN1O00255 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEN1O00255 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEN1O00255 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEN1O00255 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEN1O00255 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEN1O00255 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEN1O00255 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEN1O00255 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEN1O00255 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEN1O00255 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEN1O00255 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEN1O00255 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEN1O00255 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEN1O00255 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEN1O00255 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEN1O00255 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEN1O00255 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEN1O00255 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEN1O00255 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEN1O00255 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms