Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10AO00220 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10AO00220 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.8 ms