Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN8O00124 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN8O00124 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms